Những năm trước, thí sinh chỉ đăng ký nguyện vọng trên hệ thống chung của Bộ nếu xét tuyển bằng điểm thi tốt nghiệp THPT. Còn đối với phương thức học bạ, đây là phương thức xét tuyển riêng của từng trường, nên thí sinh chỉ cần đăng ký trên hệ thống của trường đó là được. Tuy nhiên, với việc đưa vào hệ thống lọc ảo chung, Bộ Giáo dục và Đào tạo yêu cầu dù thí sinh xét tuyển bằng phương thức khác (học bạ, xét tuyển kết hợp, xét tuyển chứng chỉ quốc tế…) cũng đều phải đăng ký chung trên hệ thống.
Ví dụ thí sinh A đăng ký xét tuyển học bạ vào trường Đại học B, nếu trường yêu cầu thí sinh phải nộp hồ sơ về trường và đăng ký trực tuyến trên website, thí sinh sẽ phải thực hiện việc đăng ký xét tuyển ở trên cả 2 hệ thống: website của trường (theo thời gian quy định) và hệ thống của Bộ Giáo dục và Đào tạo (sau khi thi TN THPT).